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白花丹参顺式还原酮加双氧酶基因的克隆和表达模式分析

摘要

目的:获得白花丹参参与乙烯和多胺合成的顺式还原酮加双氧酶(ARD)基因序列,并进行生物信息学分析和初步的表达特性研究。rn 方法:利用cDNA文库技术,从两年生白花丹参根中获得目的基因。利用BLAST进行序列比对,ORFFinder寻找该基因的开放读码框,prosite分析蛋白质的基本结构域。用半定量RT-PCR检测其在丹参组培苗根、茎、叶中的表达情况。rn 结果:得到一个顺式还原酮加双氧酶(ARD)基因全长序列,全长688 bp。具有一个591 bp的开放读码框,编码196个氨基酸。使用预测的SmARD蛋白序列在NCBI中进行蛋白保守域分析,发现SmARD与ARD/ARD1家族具有很高的同源性,命名为SmRAD。半定量RT-PCR表明,SmARD在白花丹参幼苗根、茎、叶和花等组织中均有转录水平的表达,但是在根部表达最强。rn 结论:得到白花丹参的顺式还原酮加双氧酶(ARD)基因序列,为其功能研究提供了基础。

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