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中国新发鼠疫疫源地菌株全基因组序列测定及其溯源分析

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鼠疫(Plague)是一种自然疫源性疾病,原本发生在鼠疫自然疫源地内的啮齿类动物之间,通过寄生于啮齿类动物体表的蚤类传播.为了进一步了解这一新发疫源地性质和流行规律，对所分离鼠疫菌及相邻疫源地鼠疫菌进行了全基因组序列测定和分析。本研究通过对全世界不同来源鼠疫菌的全基因组序列分析，获得了已测序各株鼠疫菌编码序列(CDS)的两两比较结果，并确定了CDS之间一一对应的同源关系。在此基础上，通过对玉龙及相邻疫源地鼠疫菌间的CDS. SNP和基因组重排的比较，显示玉龙菌株D106004与西藏菌株2176003CDS的同源性最高，重排片段最少，亲缘关系最相近。

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来源
《2010中国人兽共患病学术交流会》|2010年|60-61|共2页
会议地点湖南衡阳
作者
申小娜;
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作者单位

中国微生物学会;

中国疾病预防控制中心传染病所;

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会议组织
正文语种
原文格式 PDF
中图分类 R378.61;
关键词
鼠疫疫源地菌株; 全基因组序列测定; 溯源分析; 亲缘关系;

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