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小麦红吸浆虫唾腺EST序列的生物信息学分析

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利用生物信息学方法,对GeneBank中收录的全部来源于小麦红吸浆虫唾腺的1 217条表达序列标签(EST)进行综合分析.分析内容包括:序列的前处理、聚类和拼接、ORF预测、基因注释及功能分类、序列的同源性分析和SSR查找与分析等.结果表明,共得到1 195条高质量的EST序列、1 047条unigenes(总长度为492.9Mbp)、785个ORF(开放阅读框)和214条SSR序列.通过注释分析发现了一些与细胞色素氧化酶、细胞色素P450、NADH氧化还原酶、热激蛋白、分子伴侣、免疫相关蛋白和信息素/气味结合蛋白等同源的具有重要生物学意义的EST序列.

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来源
《中国植物保护学会2010年学术年会》|2010年|240-247|共8页
会议地点河南鹤壁
作者
段云; 武予清; 蒋月丽; 苗进; 吴仁海;
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作者单位

中国植物保护学会;

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会议组织
正文语种
原文格式 PDF
中图分类 S435.122.1;
关键词
小麦; 红吸浆虫; 唾腺结构; 表达序列标签; 生物信息学;

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