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家蚕BmColⅣα1基因的结构特征与表达谱分析

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线虫emb-9基因和let-2基因分别编码Ⅳ型胶原蛋白质（ColⅣ）α1链和α2链，两者的Gly-X-Y重复区域氨基酸残基的突变能引起胚胎期温敏性致死。本文利用网络公共数据库资源，结合RACE技术和生物信息学方法，从家蚕克隆和分析了线虫let-2基因的同源基因（BmColⅣα1）。BmColⅣα1基因全长6583 bp（Genbank：EU183410），含4个外显子，cDNA全长3847bp（Genbank 登录号：EU183409），最大ORF 2460 bp（694nt-3153nt），编码820个氨基酸残基，理论分子量82.1K，等电点6.43。BmColⅣα1蛋白质有2个胶原蛋白保守区和9个PFAM结构域，跨膜区域分析和亚细胞定位分析显示为细胞外分泌型蛋白质。基因电子表达谱分析结果表明，BmColⅣα1基因在家蚕脂肪体、卵巢、精巢、血细胞、翅原基、上颌骨突起物、滤泡细胞、复眼、大脑等组织中均有表达，以脂肪体和血细胞中表达量最大。蛋白质同源性分析和分子进化分析结果，BmColⅣα1与果蝇、蜜蜂和冈比亚按蚊中的ColⅣα1亲缘关系最近，所以命名为Ⅳ型胶原α1链基因（BmColⅣα1）。从家蚕胚胎温敏性致死系统（sch）蚕卵中克隆的BmColⅣα1基因存在8个SNP位点，分别为T242A、T279A、T556C、C675T、T1343C、A1463G、T1574C和K2014T，其中5个SNP位点引起氨基酸的改变，分别为L81Q、S186P、L448S、Q488R、V525A和G672W，分子建模分析结果，其中L81Q、S186P、L448S、Q488R和V525A 5个氨基酸残基突变位于蛋白质的4个三倍螺旋重复片段。

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来源
《中国蚕学会第六届家蚕和柞蚕遗传育种暨蚕桑产业技术体系遗传育种学术研讨会》|2009年|217-223|共7页
会议地点内蒙古海拉尔
作者
季明明; 鲁延军; 甘丽萍; 牛艳山; 司马杨虎; 徐世清;
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作者单位

中国蚕学会;

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会议组织
正文语种
原文格式 PDF
中图分类体细胞遗传变异;
关键词
家蚕; Ⅳ型胶原蛋白质基因; 温敏致死; 生物信息学; 表达谱; 遗传育种;

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