基于16SrRNA基因的PCR-DGGE技术解析不同品种四川发酵泡菜中的微生物群落结构

摘要

为了解传统四川发酵泡菜中的微生物的多样性,本文采用变性梯度凝胶电泳技术(Denatured Gradient Gel Electrophoresis,DGGE)对不同品种的四川泡菜样品中的微生物菌群结构进行了解析.结果显示,不同品种泡菜样品中的微生物菌群结构存在差异,但优势微生物相同.条带测序结果发现,检测到的细菌有3个门8个属,分别为Firmicutes、Proteobacteria和Deinococcus-Thermus, 以及 Lactobacillus、 Pediococcus、Weissella、Undibacterium、Acinetobacter、Pseudomonas、Marinobacter和Thermus;真菌有5个属,分別为Debaryomyces、Pichia,Candida、Starmerella和Uncultured fungus.其中优势细菌是Lactobacillus和Pediococcus,优势真菌是Debaryomyces和Candida.同时发现泡菜和泡菜水中所含微生物的数量存在差异,但是种类基本相似.本文研究结果展示了不同品种四川发酵泡菜中微生物的多样性,同时为不同原料发酵泡菜的工业化生产奠定理论基础.

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