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鸡传染性支气管炎病毒广西分离株S1基因高变区Ⅰ序列测定及同源性分析

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对广西1985-2007年间分离到的22株传染性支气管炎病毒(IBV)的S1基因高变区Ⅰ(HVRI)进行序列测定,并与发表的其他IBV参考株及鸽子分离的冠状病毒株的基因序列进行比较和分析。系统进化关系显示毒株可分为5个基因群,其中有16个广西分离株属第Ⅰ群,它们与鸽子冠状病毒分离株的氨基酸序列同源性较高,与Masschusetts (Mass)型疫苗株的同源性较低。有15个分离株在33～34位和34～35之间分别有4个和3个氨基酸残基的插入,GX-NN6在33～34位和34～35位之间则均有4个氨基酸残基的插入;GXYL1、GX-NN2与常用的Mass型疫苗株的亲缘关系最近,同属于第Ⅱ群;GX-G、GX-XD与日本同一时期分离的毒株JP Miyazaki 89亲缘关系最近,属于第Ⅲ群;GX-YL6、GX-NN7与欧洲毒株4/91亲缘关系较近,属于第Ⅴ群。本研究的结果表明广西存在着多种类型IBV毒株的流行,毒株S1基因HVR Ⅰ碱基的突变或插入比较普遍,可导致其氨基酸序列的变化,绝大部分毒株与目前常用的Mass型疫苗株的亲缘关系较低。同一时期的分离株同源性较高,但无明显的地域性差异。

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来源
《第三届中国畜牧科技论坛》|2007年|613-620|共8页
会议地点重庆
作者
磨美兰; 韦正吉; 韦平; 李孟; 陈秋英; 韦天超; 李康然;
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作者单位

中国农学会;

中国畜牧兽医学会;

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会议组织
正文语种
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中图分类
关键词
传染性支气管炎病毒; 分离株; S1基因高变区Ⅰ; 序列测定; 同源性分析;

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