短肽淀粉样聚集和纳米结构自组装的分子动力学模拟研究

摘要

采用粗略化和全原子分子动力学模拟,首先研究了由600个FF和FFF在不同浓度下的组装过程和组装体结构,得到了与实验结果一致的FF的纳米囊(直径10nm)和纳米管(直径5nm)结构,以及FFF的纳米球和纳米棒结构。自由能景观图分析发现:FF和FFF呈现出不同的组装路径。相互作用分析表明FF和FFF形成不同纳米结构主要是由于FF和FFF的侧链与主链相互作用竞争能力的不同导致的。最后提出实验上发现的大尺度纳米结构是由小尺度纳米结构多次融合形成的。

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