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基于SWISS-MODEL的μ阿片受体三维结构模建

摘要

蛋白质的三级结构预测可通过同源建模、反向折叠和从头预测等方法进行,但同源建模是应用最为广泛的方法.SWISS-MODEL是一个免费的蛋白质同源模建服务器.通过对比多个与μ阿片受体同属G蛋白偶联受体的视紫红质蛋白序列,选择以同源性最高的牛视紫红质蛋白1F88为模板,基于SWISS-MODEL模建了μ阿片受体的三维结构并预测了二级结构.模型的可靠性经Ramachandran图和ProTable验证,并进行了平均疏水性分析,结果表明模建的结果是合理的,为合理设计μ阿片受体的激动剂和拮抗剂提供依据,进一步指导了药物分子设计.

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