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海洋来源链霉菌属SCSIO 3406中phenaziterpene的生物合成研究

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本研究围绕phenaziterpene的生物合成途径展开研究，首先对phenaziterpene产生菌进行全基因组扫描测序，利用生物信息学分析鉴定了可能的phenaziterpene生物合成基因簇，该基因簇长约22kb，包含36个开放阅读框，其中可以直接进行基因功能注释的ORF有8个，orfl3编码的蛋白与吩嗪酸生物合成途径中的属于甾酮异构酶家族的PhzB具有很高的同源性，提示其可能参与phenaziterpene结构中吩嗪酸母核的生物合成;orf8编码的蛋白与氧甲基转移酶具有较高的同源性，推测其可能参与phenaziterpene结构中氧甲基结构的生物合成。随后，首先构建了phenaziterpene产生菌基因组文库，根据推测获得的基因簇的序列信息，分别设计引物以扩增吩嗪酸合酶基因orf13和氧甲基转移酶基因orf28的部分片段为筛选探针，利用混合PCR方法筛选到了7个可重叠覆盖phenaziterpen基因簇的cosmid。接下来，对获得的cosmid在异源宿主中进行表达，以对生物信息学获得的基因簇进行验证以及尝试获得新的phenaziterpen结构衍生物;并且利用PCR-targeting技术对关键生物合成基因进行体内敲除，对其确切的功能进行体内研究。目前，此方面的实验正在进行中。本研究还将拟对phenaziterpen基因簇中的关键生物合成基因进行克隆、表达及纯化，以相应的化合物作为底物，进行体外酶反应，对其酶促机制进行深入研究。本研究对Phenaziterpene的生物合成途径，对于发现新的功能酶以及对其它吩嗪类化合物的生物合成机制的阐明具有重要意义。

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来源
《2014年中国药学大会暨第十四届中国药师周》|2014年|1-2|共2页
会议地点石家庄
作者
程伟鸽; 李青连; 鞠建华;
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作者单位

中国药学会;

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会议组织
正文语种
原文格式 PDF
中图分类药物生物学;
关键词
吩嗪类化合物; 生物合成机制; 海洋放线菌; 基因序列;

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