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CRISPR在细菌分型中的研究进展

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本文主要介绍了CRISPR系统的在分型方面的研究进展,指出CRISPR参与的免疫过程主要包括3个阶段：适应、表达和干扰，目前CRISPR-cas系统根据结合的cas蛋白以及crRNA的加工不同被大致分为3种类型（I、II、III型），每一种类型下面又有更细的分类，利用CRISPR位点进行细菌分型的方法已经被广泛应用一些细菌中，例如结核分枝杆菌、沙门菌等。将CRISPR间隔区序列应用到间隔区寡核苷酸分型法中，对于结核分枝杆菌的分型应用开启了CRISPR分型的先河，让人们认识到CRISPR在区分一些基因序列同源性较高的细菌方面有比较好的效果。后面针对不同的细菌，研究人员都进行了尝试，包括鼠疫杆菌、植物源解淀粉欧文氏菌[2引等。直到2012年在沙门菌上面的应用，法国科学家建立了一个国际性的开放数据库，供全世界研究者进行数据分享和交流，使得该方法有了长足的发展。随着研究的深入，CRISPR与其他分型方法的结合运用日益成为热点，包括MLST、MVLST、PFGE、RFLP、VNTR等。就目前的研究结果来看，CRISPR与其他分型方法结合使用对细菌的更进一步区分有很好的分辨力，特别是针对某个血清型或者某个PFGE型的时候。

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来源
《21世纪第五届全国人兽共患病学术研讨会》|2016年|8-14|共7页
会议地点江苏扬州
作者
张文海; 孙林; 焦新安;
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作者单位

中国微生物学会;

中国疾病预防控制中心;

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会议组织
正文语种
原文格式 PDF
中图分类病原细菌;
关键词
病原菌; 细菌分型; CRISPR基因;

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