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乙型乙脑病毒减毒中间株SA14-12-1-7基因组全序列的测定

摘要

目的 对乙型脑炎活疫苗减毒过程中间株SA14-12-1-7株进行全序列测定和分析,进一步了解乙脑活疫苗减毒及其稳定性的分子机制.方法 根据已发表的SA14-14-2株及SA14株的序列,设计6对重叠引物,涵括整个乙脑病毒的基因组,通过RT-PCR扩增出SA14-12-1-7株的各cDNA片段,分别克隆到pGEM-T载体,转化至TG1受体菌中,挑取阳性克隆进行鉴定后测序.结果 SA14-12-1-7株基因组全序列长1076个核苷酸,从96到10394为一个长开放读码框,编码3432个氨基酸.与野毒株SA14和疫苗株SA14-14-2的核苷酸序列和氨基酸序列相比,同源性均在99﹪以上,突变位点分散于各个区域,E区有5个位点与疫苗株一致而与野毒株不同,3个位点与野毒株一致而与疫苗株不同,推测与其容易产生回复突变、恢复毒力有关.此外,NS3、NS5和3'NTR的几个位点可能与病毒毒力稳定性相关.结论 乙脑病毒减毒中间株的基因组全序列基本类似于已发表的序列,若干突变位点影响病毒的弱毒性及毒力的稳定性.全序列的测定对于研究疫苗株的减毒机理具有重要意义.

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