MicroRNAs(miRNAs)是一类由22个核苷酸(nt)组成的RNA分子,对多细胞动物基因表达起关键调控作用.自发现lin-4 and let-7参与调控秀丽隐杆线虫的发育时序以来,线虫中有超过175个miRNAs基因被陆续鉴定.为探究miRNAs是否参与线虫天然免疫,运用RNA深度测序技术,对病原菌PA14侵染的C.elegans进行miRNA表达分析,结果显示PA14侵染线虫4h、8h、12h后,上调和下调的miRNAs分别是:4h有32个和45个,8h有43个和23个,12h有72个和43个.猜测细菌侵染时,线虫通过上调某些miRNAs来发挥其天然免疫作用.研究表明依赖于miRNA的信号通路可能影响线虫的天然免疫，这项研究从分子水平衔接了免疫反应和未折叠蛋白反应。
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