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我国南部9省区水稻四种主要病毒的检测及遗传多样性分析

摘要

南方水稻黑条矮缩病毒(southern rice black streaked dwarf virus,SRBSDV)、水稻齿叶矮缩病毒(rice ragged stunt virus,RRSV)、水稻瘤矮病毒(rice gall dwarf virus,RGDV)和水稻黑条矮缩病毒(rice black streak dwarf virus,RBSDV)是引致中国水稻病毒病的重要病原病毒。为了解上述4种病毒在中国南方稻区的分布情况及其遗传多样性,本研究采用RT-PCR技术对采自海南(64份)、广东(184份)、广西(52份)、湖南(32份)、福建(26份)、江西(50份)、安徽(31份)、贵州(14份)、云南(17份)9个省区共470份水稻样品进行了检测,结果表明,SRBSDV和RRSV在9省区均有分布,RGDV仅在广东和海南两省发现,RBSDV仅在福建和安徽两地发现,其中SRBSDV、RRSV、RGDV和RBSDV检出率分别为49.4%、38.3%、11.3%和0.02%,发现存在SRBSDV和RRSV、SRBSDV和RGDV及RRSV和RGDV复合侵染的样品,未发现SRBSDV和RBSDV复合侵染的样品。SRBSDV CP基因核苷酸同一率为97.7%—l000/o,RRSV CP基因核苷酸同一率为92.2%—l00%,RGDV CP基因核苷酸同一率为94.2%—100%,RBS-DV CP基因核苷酸同一率性为92.2%-1000/o,表明中国南部9省区上述4水稻病毒的变异幅度均较小,但RRSV变异稍大,RGDV次之。

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