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禾谷孢囊线虫(Heterodera avenae)不同龄期转录组比较分析

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本文以小麦为研究对象，以纯系禾谷孢囊线虫群体为研究对象分别对侵染前J2、四龄雌虫和白孢囊3个不同龄期的转录组进行测序并分别获得了49532552个、46759702个和47668102个高质量的reads；通过RPKM值比较发现：与J4雌虫相比，在侵染前J2s中上调表达的Transcripts数为1101，下调表达1894个；在白孢囊中上调表达的Transcripts数为2905，下调表达1689个；与白孢囊相比，在J4雌虫中上调表达的Transcripts数为285，下调表达的为123个，从三个转录组序列中共鉴定筛选出已报道的效应蛋白471个；其中与c.elegans没有同源性，同时满足具有信号肽但不具有跨膜结构域的差异性表达的新型效应因子共133个。具有RNAi致死表型的Unigenes227个，这些有致死表型的基因序列在小麦禾谷孢囊线虫抗性育种中都有重要的作用，是小麦禾谷孢囊线虫抗性育种中潜在的理想RNAi靶标基因序列。

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来源
《中国植物病理学会2014年学术年会》|2014年|439-440|共2页
会议地点沈阳
作者
Cui Jiangkuan; 崔江宽; Wang Gaofeng; 王高峰; Peng Huan; 彭焕; Huang Wenkun; 黄文坤; Kong Lingan; 孔令安; Peng Deliang; 彭德良;
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作者单位

中国植物病理学会;

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正文语种
原文格式 PDF
中图分类虫害;
关键词
小麦; 禾谷孢囊线虫; 侵染机制; 转录组; 基因表达;

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