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斑茅铜锌超氧化物歧化酶基因(SaSOD-1)的克隆与比较分析

摘要

目的:为甘蔗的抗旱基因工程育种提供理论依据和候选基因.方法:以甘蔗近缘种斑茅为材料,采用同源克隆的方法,以高粱Cu/Zn-SOD(登录号:XM 002445626.1)cDNA序列为探针,对甘蔗属EST数据库进行检索、比对和拼接,并设计特异引物.结果:克隆获得了2个Cu/Zn-SOD(SaSOD-1a和SaSOD-1b,登录号:KJ001795和KJ001796)基因全序列,其中SaSOD-1a基因组序列全长2473bp,SaSOD-1b基因组序列全长2228bp,均有8个外显子,7个内含子,其cDNA序列长度均为692bp,编码206个氨基酸.序列比较分析表明,SaSOD-1a和SaSOD-1b序列相似性为98.6%,有8个单核苷酸多态性位点,蛋白质相似性为99.0%,2个氨基酸变异位点.用推导出的氨基酸序列与其它植物做同源进化分析,均表现出较高的保守性.结论:基因的获得为进一步了解超氧化物歧化酶与斑茅耐旱性的关系奠定了基础.

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