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全基因组多重置换扩增嵌合热点扫描的研究

摘要

基于多重置换扩增的全基因组扩增技术使用的phi29DNA聚合酶具有起始DNA需求量低、保真度高、校读性好、产物片段长并且偏向性低等优点,然而人们对于phi29酶进行等温扩增的机制和其潜在的缺点却知之甚少,phi29DNA聚合酶扩增产生的嵌合序列影响后期的数据分析.在扩增过程中,基因组上的嵌合热点是形成嵌合序列的潜在区域,本研究结合测序数据中找到的嵌合序列的特征和人类基因组hg19上的嵌合热点的扫描结果分析,从基因组序列结构的角度解释嵌合序列的产生,为减少嵌合序列指出了优化方向,有利于减少嵌合序列的产生.

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