牦牛基因组重测序及遗传变异分析

摘要

牦牛是青藏高原牧区的优势家畜品种,也是牛属动物中唯一能适应高寒高海拔气候而延续至今的珍稀畜种资源.然而迄今为止,仍然没有基因组水平的遗传变异研究,限制了牦牛的遗传和育种研究工作,特别是对野生牦牛遗传资源的开发和利用.利用第二代高通量测序技术完成了3头野生牦牛和1头家养牦牛5X基因组覆盖度的重测序;通过与牦牛基因组进行比对,识别出812万个单核苷酸多态性位点(SNP),33万个插入缺失位点(InDEL)和15万个结构变异(SV);并识别出超过一千个受到人工选择的基因组区域.本研究构建的牦牛全基因组变异图谱能够为未来牦牛遗传多样性和遗传育种研究提供有价值的资源。

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