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基于人工免疫系统的蛋白质相互作用网络聚类算法

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提出了一种基于人工免疫特性的蛋白质相互作用(PPI)网络聚类模型与算法以期提高其辨识准确率.在该算法中将聚类中心作为抗原,将邻接的节点作为抗体,通过计算抗体与抗原之间的亲和度,将其作为记忆细胞把节点划分到聚类中;然后选择优秀抗体作为疫苗,尝试将疫苗注入聚类模块并进行更新,通过与注射前的模块适应度进行比较,不断更新记忆细胞.对PPI数据集上的数据进行了仿真,实验结果表明,与功能流算法(FLOW)相比,所提方法的正确率和查全率的几何平均值均得到了提高.

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来源
《2013年全国开放式分布与并行计算学术年会》|2013年|3567-3570|共4页
会议地点昆明
作者
WANG Chong; 王冲; LEI Xiujuan; 雷秀娟;
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作者单位

中国计算机学会;

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会议组织
正文语种
原文格式 PDF
中图分类医学免疫学;
关键词
人工免疫系统; 蛋白质相互作用; 聚类算法; 性能测试;

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