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淇河鲫IL-8cDNA克隆及组织表达分析

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采用同源克隆和末端快速扩增(RACE)方法,从淇河鲫(Carassius auratus in Qihe river)总RNA反转录产物中获得了641bp IL-8 cDNA序列,其中包含102bp的5'非编码区,242bp 3'非编码区和297bp的开放阅读框.该基因编码由98个氨基酸残基组成的前体蛋白,前22个氨基酸残基为信号肽.肽链中含有4个保守半胱氨酸,前2个半胱氨酸被1个精氨酸分隔,形成CXC结构.第一个半胱氨酸前缺乏ELR基序,其组成是DPR.氨基酸同源性分析显示,淇河鲫IL-8与鲤IL-8的同源性最高(94％).进化分析显示,淇河鲫IL-8与鲤、鳙鱼、草鱼、鲢鱼等鲤科鱼类的进化关系最近.通过实时荧光定量PCR检测,淇河鲫IL-8在被检测的8个组织中都有表达,其中在肌肉中的表达量最高,其次为脾脏、头肾和脑等.

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来源
《2013第一届中部地区水产饲料实用技术论坛》|2013年|320-325|共6页
会议地点武汉
作者
王俊丽; 雒燕婷; 郝光; 孙君君; 段艳艳; 李学军; 孔祥会; 聂国兴;
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作者单位

华中农业大学;

中国科学院水生生物研究所;

中国水产科学研究院;

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会议组织
正文语种
原文格式 PDF
中图分类鲫鱼;
关键词
淇河鲫; 基因克隆; 蛋白表达;

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