口蹄疫病毒NMXW-99疫苗株VP1基因的克隆与序列分析

摘要

根据已知O型口蹄疫病毒的核酸序列,设计并合成了一对用于扩增VP1基因的引物,提取O型口蹄疫病毒NMxw-99疫苗株的病毒RNA,经RTPCR法扩增了病毒的VP1基因片段,克隆后通过测序获得其核苷酸序列并推导出相应的氨基酸序列,将NMxw-99株VP1基因核酸序列及氨基酸序列与其它已知O型口蹄疫病毒的VP1基因进行比较分析.结果表明,NMxw-99株病毒与O/TAW/2/99/BOV、O/China/1/99(Tibet)、O/Tibet/CHA/99、O/UKG/35/2001、O/SAR/19/2000、O/JPN/2000、O/SKR/2000等泛亚株(PanAsia)毒株的同源性为98.1﹪~99.1﹪,为相同的基因型,NMxw-99株病毒属于泛亚毒株(PanAsia).而与O1k、O1/Campos、O/Chu-Pei/Taiwan、O/Taiwan/Yunlin/97、O/HKN/2002和O/Akesu/58等毒株的同源性为77.3﹪~81.7﹪;为不同的基因型。

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