广西高致病性H5亚型禽流感血凝素基因序列分析

摘要

利用RT-PCR技术,对4个H5亚型AIV分离株的HA基因进行扩增,通过对RT-PCR产物直接测序,获得了4个全长均为1640bp的HA基因序列.利用计算机分析软件,对这些分离株的HA核苷酸序列及推导的氨基酸序列进行分析.比较分析了这些分离株之问及其与参考株之间的核苷酸/氨基酸同源性,以及这些毒株的HA裂解位点、受体结合位点和潜在的糖基化位点等的氨基酸组成.结果显示,这4个分离株与广东、香港、泰国和意大利参考毒株具有较近的亲缘关系,系统进化树结果表明这4个分离株同属欧亚谱系.

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