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杜梨2个MYB转录因子基因的克隆及序列分析

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目的：克隆杜梨(Pyrus betulifolia Bunge)MYB家族的2个基因(Pb3RMYB和Pb4RMYB),分析其序列特征,为研究其调控的分子机制奠定基础. 方法：利用RT-PCR和RACE技术克隆杜梨Pb3RMYB和Pb4RMYB的cDNA序列全长;利用BLAST和ORF Finder对核酸序列进行分析,利用CDD、ProtParam、TMHMM、SignalP、Plant-mPloc、SPOMA、DANMAN、MEGA6等软件对氨基酸序列进行分析. 结果：克隆得到Pb3RMYB和Pb4RMYB基因全长,GenBank登录号分别为KX272614和KX272615.2者均含有MYB保守结构域,二级结构均以无规则卷曲、α-螺旋、延伸链和β-折叠为主,亚细胞定位分析表明2者均定位于细胞核中.其中,Pb3RMYB属于3R-MYB亚家族,全长2355bp,ORF长1710bp,编码569个氨基酸,蛋白分子质量约为62077.3Da,等电点为7.08;BLAST分析表明Pb3RMYB与已报道的其他物种3RMYB具有较高的相似度.Pb4RMYB属于4R-MYB亚家族,全长3625bp,ORF长2913bp,编码970个氨基酸,蛋白分子质量约为109600.6Da,等电点为7.41. 结论：获得了2个杜梨MYB基因Pb3RMYB和Pb4RMYB,分别属于3RMYB和4R-MYB亚家族.

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来源
《第八届全国梨科研、生产与产业化研讨会》|2016年|52-58|共7页
会议地点山东泰安
作者
RAN Kun; 冉昆; WANG Shaomin; 王少敏; DONG Fang; 董放; WEI Shuwei; 魏树伟; ZHANG Yong; 张勇; WANG Hongwei; 王宏伟;
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作者单位

中国园艺学会;

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会议组织
正文语种
原文格式 PDF
中图分类 S661.2:S603.8;
关键词
杜梨; Pb3RMYB基因; Pb4RMYB基因; 基因克隆; 序列分析;

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