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利用113Cd和异核NMR方法解析一个CXC结构域的Zn3Cys9簇的配位、结构和DNA结合界面

摘要

本研究克隆了一个CXC结构域,在表达纯化过程中,使用通过核磁共振方法对蛋白质的性质进行了分析,通过质谱测定发现蛋白质中包含有三个Zn离子.由于Zn的核磁共振信号难以观测,使用113Cd取代了蛋白中的Zn离子.利用一维113Cd和二维异核1H-113Cd HSQC,1H-113Cd HMQC-TOCSY方法,测定了三个Cd原子和半胱氨酸的配位关系,发现了一类新的Zn3Cys9簇.结合15N,13C双标记和三共振方法,成功解析了该结构域的结构.通过DNA滴定,测定了该结构域的DNA结合界面和解离常数,并进一步通过突变分析证实了DNA结合界面的关键残基.

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