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基于元基因组学的基因资源研究与开发——瘤胃及热泉微生物组(microbiomes)

摘要

中国科学院微生物所的微生物资源中心开展元基因组为技术支撑的基因资源挖掘,本文开展了瘤胃纤维素酶基因资源及其纤维素降解机制的研究,及热泉高温酶的基因开发。为了认识和利用瘤胃中的纤维素降解酶基因,本文构建了耗牛瘤胃BAC表达文库,并对筛选到的223个具有纤维素酶,木聚糖酶,酷酶或脂肪酶活性的克隆进行了高通量测序。对代表瘤胃优势菌群的拟杆菌的、纤维素降解基因簇的连锁基因的分析发现,它们多数与细胞膜蛋白基因susC(糖利用系统)和susD连锁。因此提出了SusC/SusD介导的拟杆菌木质纤维素降解模型。此外,对优势的新内切酶GHS亚家族6和7的蛋白表征,显示具有弱的外切纤维素酶活力,可能解释了瘤胃中无外切纤维素酶,而高效降解木质纤维素的原因。

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