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利用EST-SSR标记分析西南扁穗牛鞭草种质的遗传多样性

摘要

利用禾谷作物EST-SSR标记对采自我国西南地区的40份野生扁穗牛鞭草(H.compressa(L.F.)R.Br.)和3份扁穗牛鞭草品种的遗传变异和亲缘关系进行了研究.试验筛选出23对引物对43份供试材料进行扩增,共获得323条带,其中多态性条带261条,多态性条带比率(PPB)达80.4%,多态信息含量(PIC)在0.354~0.500之间,平均值为0.474,遗传相似系数(GS)为0.690~0.913,表现出丰富的遗传多样性.聚类分析结果表明,各供试材料间的聚类与其地理来源及形态特征具有一定的相关性.5个扁穗牛鞭草地理类群间的分子方差分析(AMOVA)揭示了供试的扁穗牛鞭草类群内的遗传变异占总变异的95.32%,类群间变异占总变异的4.68%.表明禾谷作物的EST-SSR能用于扁穗牛鞭草遗传多样性研究,是一种有效的分子标记.本研究结果为扁穗牛鞭草种质的收集、利用及育种提供了理论依据.

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