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基于硬件加速的生物序列比对研究综述

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生物序列比对是生物信息学领域重要的研究工具,主要用于确定序列的生物属性.由于该领域应用的广泛性、计算的复杂性以及海量数据特征,对计算机性能提出越来越高的高求,迫切需要高性能计算的支持.对基于硬件加速的生物序列比对进行综述,侧重从高性能计算对序列比对领域的影响及挑战的角度,按照比对时所使用的体系结构的区别,对目前基于硬件加速的序列比对方法进行了归类;分别对各类方法作了深入的对比分析并总结出技术难点;最后,经过对现有研究工作的分析,对该领域存在的问题作出了总结,展望了今后的发展方向.

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来源
《2012全国高性能计算学术年会》|2012年|1-8|共8页
会议地点张家界
作者
Zhu Xiangyuan; 朱香元; Li Renfa; 李仁发;
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作者单位

中国计算机学会;

中国软件行业协会;

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会议组织
正文语种
原文格式 PDF
中图分类生物工程学（生物技术）;
关键词
生物信息; 序列比对; 硬件加速; 高性能计算;

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