长毛明对虾微卫星的分离及筛选

摘要

采用磁珠富集法构建长毛明对虾(Fenneropenaeus penicillatus)基因组微卫星富集文库,并对文库进行筛选、测序与引物多态性筛选。长毛明对虾的(GT)n或(CT)n微卫星富集文库包含653个克隆,从中挑选88个片段大小大于500bp的克隆进行测序,测序获得42个微卫星序列(n≥5),阳性克隆率为47.7%。基于微卫星两端的侧翼序列设计并获得了20对能够在长毛明对虾基因组有效扩增的微卫星引物,其中6对引物在种群中(n=30)具有扩增多态性,这6对引物可以对进一步开展长毛明对虾群体的遗传多样性和遗传分化的研究提供理论基础。

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