• 主题
高级搜索  >
历史搜索 清空历史
首页> 外文会议>Asia-Pacific Bioinformatics Conference(APBC 2003); 200302; Adelaide(AU) >A New Program to Compute the Surface Properties of Biomolecules
【24h】

A New Program to Compute the Surface Properties of Biomolecules

机译：计算生物分子表面性质的新程序

获取原文
获取原文并翻译 | 示例
页面导航
  • 摘要
  • 著录项
  • 相似文献
  • 相关主题

摘要

The interactions of large molecules with surfaces and with each other are strongly dependent upon their surface, rather than their bulk properties. In addition, the local properties of biomolecular surfaces are very important in their own right in biomedicine and other areas, for example for locating binding sites. Following to previous work, we have developed a program to compute to compute amino acid and atom-based surface descriptors, and used it to generate a small database of charge and hydrophobicity-related surface properties for a set of proteins. The program requires the user to input two text files: one assigning a real number to each atom of each amino acid, and one assigning a real number to each amino acid. Although we have so far only computed surface charge (atom-based) and surface hydrophobicity (amino acid-based), we note that this program could be used to compute any surface parameter whatsoever, since the user can assign arbitrary atom-by-atom and amino acid properties. We discuss possible applications of this program and describe one current application, the Biomolecular Adsorption Database.
机译：大分子与表面以及彼此之间的相互作用在很大程度上取决于其表面，而不是其整体性质。另外，生物分子表面的局部性质就其自身而言在生物医学和其他领域中非常重要，例如对于定位结合位点。在完成之前的工作之后，我们开发了一个程序来计算基于氨基酸和原子的表面描述符，并使用它为一组蛋白质生成一个小的电荷和疏水性相关表面特性数据库。该程序要求用户输入两个文本文件：一个为每个氨基酸的每个原子分配一个实数，另一个为每个氨基酸分配一个实数。尽管到目前为止我们只计算了表面电荷（基于原子）和表面疏水性（基于氨基酸），但我们注意到该程序可用于计算任何表面参数，因为用户可以按原子分配任意原子和氨基酸特性。我们讨论了该程序的可能应用，并描述了一种当前的应用，即生物分子吸附数据库。

著录项

相似文献

  • 外文文献
  • 中文文献
  • 专利
获取原文

客服邮箱：kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备：11010802029741号 ICP备案号：京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有

  • 客服微信

  • 服务号