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Biological Network Inference Using Redundancy Analysis

机译:使用冗余分析的生物网络推断

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摘要

The paper presents MRNet, an original method for inferring genetic networks from microarray data. This method is based on Maximum Relevance - Minimum Redundancy (MRMR), an effective information-theoretic technique for feature selection. MRNet is compared experimentally to Relevance Networks (RelNet) and ARACNE, two state-of-the-art information-theoretic network inference methods, on several artificial microarray datasets. The results show that MRNet is competitive with the reference information-theoretic methods on all datasets. In particular, when the assessment criterion attributes a higher weight to precision than to recall, MRNet outperforms the state-of-the-art methods.
机译:本文介绍了MRNet,这是一种从微阵列数据推断遗传网络的原始方法。此方法基于最大相关性-最小冗余(MRMR),这是一种用于特征选择的有效信息理论技术。在几个人工微阵列数据集上,将MRNet与相关网络(RelNet)和ARACNE(两种最新的信息理论网络推断方法)进行了实验比较。结果表明,MRNet在所有数据集上均具有参考信息理论方法的竞争力。尤其是,当评估标准将较高的权重归因于精度而不是召回率时,MRNet优于最新方法。

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