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TTP: Tool for Tumor Progression

机译:TTP:肿瘤进展工具

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摘要

In this work we present a flexible tool for tumor progression, which simulates the evolutionary dynamics of cancer. Tumor progression implements a multi-type branching process where the key parameters are the fitness landscape, the mutation rate, and the average time of cell division. The fitness of a cancer cell depends on the mutations it has accumulated. The input to our tool could be any fitness landscape, mutation rate, and cell division time, and the tool produces the growth dynamics and all relevant statistics.
机译:在这项工作中,我们提出了一种用于肿瘤进展的灵活工具,它​​可以模拟癌症的进化动力学。肿瘤进展实现了多种类型的分支过程,其中关键参数是适应度,突变率和平均细胞分裂时间。癌细胞的适应性取决于其积累的突变。我们工具的输入可以是任何适应度图,突变率和细胞分裂时间,并且该工具会产生生长动态和所有相关统计数据。

著录项

  • 来源
    《Computer aided verification》|2013年|101-106|共6页
  • 会议地点 Saint Petersburg(RU)
  • 作者单位

    IST Austria (Institute of Science and Technology Austria), Klosterneuburg, Austria;

    Program for Evolutionary Dynamics, Harvard University, Cambridge, USA ,Department of Mathematics, Harvard University, Cambridge, USA;

    IST Austria (Institute of Science and Technology Austria), Klosterneuburg, Austria;

    Program for Evolutionary Dynamics, Harvard University, Cambridge, USA ,Department of Mathematics, Harvard University, Cambridge, USA ,Department of Organismic and Evolutionary Biology, Harvard University, Cambridge, USA;

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  • 正文语种 eng
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