• 主题
高级搜索  >
历史搜索 清空历史
首页> 外文会议>International Conference on Bioinformatics and Biomedicine Workshops >PACSY database, a relational database management system for protein structure and nuclear magnetic resonance chemical shift analysis
【24h】

PACSY database, a relational database management system for protein structure and nuclear magnetic resonance chemical shift analysis

机译：PACSY数据库，蛋白质结构和核磁共振的关系数据库管理系统

获取原文
页面导航
  • 摘要
  • 著录项
  • 相似文献
  • 相关主题

摘要

We developed a new relational database management system called PACSY (Protein structure And Chemical Shift NMR spectroscopy) by integrating information from the Protein Data Bank (PDB), the Biological Magnetic Resonance Data Bank (BMRB), and the Structural Classification of Proteins (SCOP) database. PACSY offers valuable information for structural investigations such as three-dimensional coordinates and chemical shifts of atoms along with derived information such as torsion angles, solvent accessible surface areas, and hydrophobicity scales. PACSY consists of six relational table types linked to one another for coherence by key identification numbers. The database can be installed on an RDBMS server such as MySQL and PostgreSQL for advanced search functions by supporting database queries. PACSY enables users to search for combinations of information from different database sources in support of their research. PACSY along with two associated software packages, PACSY Maker for database creation and PACSY Analyzer for database analysis, are available from http://pacsy.nmrfam.wisc.edu.
机译：我们开发了一种新的关系数据库管理系统，通过将信息从蛋白质数据库（PDB），生物磁共振数据库（BMRB）和蛋白质（SCOP）的结构分类集成，通过将信息与蛋白质数据库（PDB）的信息进行整合，以及蛋白质（SCOP）的结构分类，以及蛋白质数据库（SCOP）的结构分类，以及蛋白质结构和化学移位NMR光谱学）。数据库。 PACSY提供了有价值的结构调查信息，例如三维坐标和原子的化学位移以及衍生信息，如扭转角度，溶剂可接近的表面积和疏水性尺度。 PACSY由六个关系表类型组成，彼此链接以通过键识别号码连贯。通过支持数据库查询，可以将数据库安装在RDBMS服务器（如MySQL和PostgreSQL）上，以便进行高级搜索功能。 PACSY使用户能够搜索来自不同数据库源的信息的组合，以支持他们的研究。与两个相关的软件包一起使用，适用于数据库创建和PACSY分析仪进行数据库分析，可从http://pacsy.nmrfam.wisc.edu获得。

著录项

相似文献

  • 外文文献
  • 中文文献
  • 专利
获取原文

客服邮箱：kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备：11010802029741号 ICP备案号：京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有

  • 客服微信

  • 服务号