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Towards a Hybrid Method for Detecting Critical Protein Residues

机译：朝着检测关键蛋白质残留的混合方法

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Some regions in proteins play a critical role in determining their structure and function. Examples include flexible regions such as hinges which allow domain motions, and highly conserved functional interfaces which allow interactions with other proteins. Detecting these regions facilitates the analysis and simulation of protein rigidity and conformational changes and aids in characterizing protein-protein binding. We present an analysis of critical residues in proteins using a combination of two complementary methods. One method performs rigidity analysis to find rigid clusters of amino acids in a protein and the other method uses evolutionary conservation to find functional interfaces in proteins. We applied both methods to a dataset of proteins, including proteins with experimentally known critical residues. The results show that the combination of the two methods can detect the vast majority of critical residues in tested proteins.
机译：蛋白质中的一些地区在确定它们的结构和功能方面发挥着关键作用。实例包括诸如允许域运动和高度保守的功能界面的铰链，允许与其他蛋白质相互作用。检测这些区域有助于蛋白质刚性和构象变化的分析和模拟，以及表征蛋白质 - 蛋白结合的助剂。我们使用两种互补方法的组合呈现蛋白质中临界残留物的分析。一种方法进行刚性分析以发现蛋白质中的刚性氨基酸簇，其他方法使用进化守恒来在蛋白质中找到功能性界面。我们将两种方法应用于蛋白质的数据集，包括具有实验已知的关键残留物的蛋白质。结果表明，两种方法的组合可以检测测试蛋白中绝大多数关键残留物。

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