中国株乙型肝炎病毒D基因型全序列分析:HBV基因型分型方法学建立及初步应用

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为了解乙型肝炎病毒(HBV)D基因型在中国有存在状况及全基因序列特征,应用在聚合酶链式反应(PCR)扩增HBV前S基因基础之上的限制性片段长度多态性(RFLP)的方法调查了中国部分地区HBV基因型分布.认为D基因型毒株在中国部分地区并非少见.全基因PCR和克隆后测定并分析了一例HBVD基因型毒株的全基因,GeneBankAccessionNumber和AF280817.认为病毒传入来源、迁移的不同及病毒在具有不同遗传和免疫特质的宿主中的长期选择可能是形成HBV同一基因型病毒株进化距离不同的原因.该文应用DNASIS和CLUSTALW分析软件将已发表的223株HBV全序列进行基因型分型、S基因核苷酸及氨基酸序列对齐比较,分析每一种基因型特有的核苷酸或氨基酸序列后发现了每一种基因型特异性的限制性内切酶,建立了S基因PCR-RFLP的基因型分型方法学,可鉴别A-F基因型.部分不同基因型标本经S基因序列测定证定了此方法的准确性.

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作者
阎丽;
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作者单位

南方医科大学;

第一军医大学;

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授予单位南方医科大学;第一军医大学;
学科传染病学
授予学位硕士
导师姓名侯金林;
年度 2001
页码
总页数
原文格式 PDF
正文语种中文
中图分类 R512.62;
关键词
乙型肝炎病毒; 聚合酶链式反应限制片段长度多态性; 无症状携带者; 基因型分型; D基因型; 中国;

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