西南地区本地黄牛及其杂交牛CAST、H-FABP、MyoD1基因部分编码区多态性分析

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第1章文献综述

1.1 Calpain家族基因的研究进展

1.1.1钙蛋白酶系统的概况

1.1.2 Calpain家族与Ca2+的关系

1.1.3 Calpain家族的分布

1.1.4 Calpain对肌肉嫩化机理

1.1.5牛Calpain家族的研究现状

1.1.6牛CAST基因研究现状

1.1.7 Calpain家族的研究前景

1.2脂肪酸结合蛋白(FABP)家族基因的研究进展

1.2.1 FABP家族的概述

1.2.2 FABPs的结构特点

1.2.3 FABPs的表达调控

1.2.4 H-FABP的研究进展

1.2.5 H-FABP的多态性的研究

1.2.6关于牛H-FABP基因研究前景

1.3 MyoD家族基因

1.3.1 MyoD家族的概述

1.3.2 MyoD家族的结构特点

1.3.3 MyoD1基因的研究进展

1.3.4 MyoD家族各成员在肌肉发育中的作用

1.3.5 MyoD1基因多态性的研究及其与生产性状关联

1.3.6 MyoD1基因的研究前景

1.4分子标记技术研究进展

1.4.1限制性片段长度多态性技术

1.4.2微卫星标记技术

1.4.3 单核苷酸多态性

1.5 PCR-SSCP基本原理与特点

第2章材料方法

2.1试验材料

2.1.1试验动物来源

2.1.2样品采集

2.1.3试验菌株及载体

2.1.4试验主要试剂

2.1.5常用溶液及试剂配制

2.2主要仪器

2.3试验方法

2.3.1基因组DNA的提取

2.3.2 DNA浓度和纯度的检测

2.3.3 PCR引物的设计与合成

2.3.4 PCR反应体系及其条件

2.3.5 PCR产物的检测

2.3.6产物的SSCP分析

2.3.7 PCR扩增产物的回收与纯化

2.3.8感受态细胞的制备

2.3.9连接反应

2.3.10转化

2.3.11菌液PCR鉴定阳性克隆、测序

2.3.12统系分析方法

第3章结果与分析

3.1耳组织基因组DNA的抽提结果

3.2 PCR-SSCP结果

3.2.1 CAST基因PCR-SSCP结果

3.2.2 H-FABP基因PCR-SSCP结果

3.2.3 MyoD1基因PCR-SSCP结果

3.3各基因型的测序结果及序列比对

3.3.1 CAST基因引物C1、C2、C3的测序结果

3.3.2 H-FABP基因引物H1、H2的测序结果

3.3.3 MyoD基因引物M1、M2的测序结果

3.4基因多态位点群体遗传学分析

3.4.1六个牛群体基因型、等位基因频率分析

3.4.2各基因遗传特性分析

3.4.3 Hardy-Weinberg平衡的检验

第4章讨论

4.1实验材料的选择和DNA的提取

4.1.1实验材料的选择

4.1.2 DNA的提取

4.2 PCR-SSCP的影响因素

4.2.1 PCR的影响因素

4.2.2 SSCP的影响因素

4.3突变位点

4.3.1 CAST基因引物C1、C2、C3扩增片段的突变位点

4.3.2 H-FABP基因引物H1、H2扩增片段的突变位点

4.3.3 MyoD1基因引物M1、M2扩增片段的突变位点

4.4 CAST基因、H-FABP和：MyoD1基因的多态性分析

4.4.1 CAST基因的多态性分析

4.4.2 H-FABP基因的多态性分析

4.4.3 MyoD1基因的多态性分析

4.5 CAST基因、H-FABP和MyoDl基因多态性的研究前景

4.5.1 CAST基因的多态性与生产性状的关联

4.5.2 H-FABP基因的多态性与生产性状的关联

4.5.3 MyoD1基因的多态性与生产性状的关联

第5章结论

参考文献

致谢

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