深度测序探讨乙肝病毒S区基因的垂直传播特征及突变对疫苗接种失败的影响

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目的：探讨乙肝病毒S区基因在垂直传播中的传播特征及S区突变对乙肝疫苗接种失败的影响。方法：本研究纳入了9对乙肝疫苗接种失败的患儿及其母亲，其中所有患儿生后都完整的接受了乙肝疫苗的接种，病程中患儿及母亲的肝功能都保持正常。首先从患者血清中提取乙型肝炎病毒(hepatitis B virus，HBV) DNA，聚合酶链反应（polymerase chain reaction，PCR）扩增HBV S区基因，并将其纯化后打断成250-500bp长度的小片段；再通过PCR方法在每个样本的小片段上加上Barcode引物序列，胶回收目的片段。最后将样本送出进行深度测序并完成生物信息学分析。结果：基因分型结果显示，所有的母子对都为基因型B和基因型C的混合感染。其中7对母子的优势基因型为基因型B，2对为基因型C，所有患儿的优势基因型和其母亲是相同的，优势基因型在垂直传播中并未发生改变。系统进化树分析显示，所有母子之间的consensus sequences的一致性高于98.5%。母子所共同含有的突变的占患儿突变的比例高，平均占比为83.13±8.45%。通过比较相同氨基酸位点的平均香农熵，发现大多数氨基酸位点的多样性在母亲和患儿之间的差异很小，母亲和患儿之间的多样性趋势保持一致。突变位点分析显示，所有母子在S区都发现了很多能引起氨基酸改变的突变位点，尤其是在含有α-抗原决定簇的主要亲水区（major hydrophilic region， MHR）。其中在所有母子对中都发现了在α-抗原决定簇中能对乙肝表面抗原结构产生重要影响的C137S或C139Y突变。结论：母亲和患儿的突变在垂直传播过程中能保持基本一致，HBV S区基因在垂直传播过程中具有高度的保守性。同时也表明能够引起免疫逃逸的突变预存于母亲体内，患儿通过垂直传播获得了含有免疫突变的乙肝病毒，从而引起了乙肝疫苗接种失败。

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作者
邹西亮;
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作者单位

重庆医科大学;

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授予单位重庆医科大学;
学科儿科学
授予学位硕士
导师姓名许红梅;
年度 2018
页码
总页数
原文格式 PDF
正文语种中文
中图分类药品;药理学;
关键词
测序; 乙肝病毒; 基因; 传播特征; 突变; 疫苗接种;

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