光信号对C4植物玉米与C3植物杨树调控作用的组学研究

摘要

1 绪论

1．1 研究背景与目的意义

1．1．1 玉米

1．1．2 杨树

1．2 C3植物与C4植物

1．2．1 光合作用及C3植物

1．2．2 C4植物

1．2．3 C3植物与C4植物的差异

1．3 植物中的光调控

1．3．1 植物光受体及光形态建成

1．3．2 玉米与杨树光调控的研究进展

1．4 转录组学研究进展

1．4．1 测序技术

1．4．2 转录组在植物科学研究中的应用

1．4．3 转录组与转录后调控

1．5 蛋白质组学研究进展

1．5．1 蛋白质组学技术

1．5．2 蛋白质组学在植物科学研究中的应用

2 不同光质下玉米黄化苗转绿过程的组学分析

2．1 实验材料及实验方法

2．1．1 实验材料

2．1 ：2实验仪器

2．1．3 主要试剂

2．1．4 主要溶液配制

2．1．5 叶绿素含量测定

2．1．6 透射电镜检测样品制备

2．1．7 叶片伸长速率测定

2．1．8 生长素提取

2．1．9 原叶绿素酸酯含量检测

2．1．10 总RNA提取

2．1．11 实时荧光定量PCR

2．1．12 苯酚抽提法提取总蛋白

2．1．13 蛋白浓度测定

2．1．14 iTRAQ样品制备

2．1．15 iTRAQ标记肽段的液相分离

2．1．16 Nano LC-MS／MS分析

2．1．17 转录组样品检测

2．2．1 不同光质处理下玉米黄化苗叶片的生理、生化变化

2．2．2 不同光质处理下玉米幼苗叶片的转录组分析

2．2．3 经6h不同光质处理的玉米黄化幼苗蛋白质组分析

2．3 讨论

2．3．1 不同光质对玉米黄化苗叶片表型调控的差异性

2．3．2 不同光质对玉米幼苗中基因转录、翻译的调控具有差异性

2．3．3 转录组及蛋白质组数据完善玉米基因组注释

2．4 结论

3 不同光质下杨树转录组分析

3．1 实验材料及实验方法

3．1．1 实验材料

3．1．2 实验仪器

3．1．3 总RNA提取

3．1．4 实时荧光定量PCR

3．1．5 转录组样品检测转录组样品检测

3．2．1 转录组原始数据分析

3．2．2 转录组中基因的差异表达分析

3．2．3 GO富集及Mapman注释分析

3．2．4 核酸代谢及转录调控相关基因

3．2．5 氨基酸及蛋白质代谢相关基因

3．2．6 细胞发育及细胞壁代谢相关基因

3．2．7 胁迫相关基因

3．2．8 基础代谢相关基因

3．2．9 激素代谢及调控相关基因

3．2．10 光合作用相关基因

3．3 讨论

3．4 结论

4 不同物种间PEPCK酶活差异及点突变对其酶活的影响

4．1 实验材料及实验方法

4．1．1 实验材料

4．1．2 实验仪器

4．1．3 主要试剂

4．1．4 总RNA提取

4．1．5 蛋白浓度测定

4．1．6 PEPCK克隆和定点突变

4．1．7 蛋白表达和体外酶测定

4．2 实验结果

4．2．1 磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶

4．2．2 PEPCK蛋白进化分析

4．2．3 C3、C4植物中PEPCK序列差异比较分析

4．2．4 PEPCK在C4和C3植物中的酶活性

4．2．5 PEPCK活性与磷酸化位点和磷酸化水平的关系

4．3 讨论

4．4 结论

5 结论

参考文献

附录

攻读学位期间发表的学术论文

致谢

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