基因型带有误差时QTL的区间定位

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随着分子遗传学和数量遗传学结合的越来越紧密，人们开始了QTL定位的研究.QTL定位是指在表型值和标记信息已知的条件下估计QTL数目、位置和基因效应，其研究对人类疾病和某些农作物经济性状的探索有很大的帮助.然而，由于人为和机械等原因，标记信息经常存在一部分错误，如果把这些信息直接当成真实的基因数据，势必给QTL的定位研究带来影响.
　　本文讨论的是使用带有误差的基因型数据进行QTL定位的统计遗传学问题.首先我们在含有误差的基因型数据的条件下考虑了每个个体的所有可能的基因型.然后在回交模型的框架下，给出模型参数的估计方法.文中我们假设所有标记位点的基因型错误率相同，然后用EM算法和加权的EM算法做参数估计.最后，我们对文中提出的方法进行广泛的模拟研究，实际结果表明本文提出的方法优于以往的方法.我们的方法能够减少基因型误差给QTL定位带来的影响.

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作者
佟良;
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作者单位

黑龙江大学;

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授予单位黑龙江大学;
学科应用数学
授予学位硕士
导师姓名周影;
年度 2013
页码
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原文格式 PDF
正文语种中文
中图分类目的基因的获得;生物数学方法;
关键词
QTL区间定位; 回交模型; EM算法; 基因型误差; 参数估计;

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