分子对接程序重构G-四链体-配体小分子复合物的能力评价

声明

摘要

缩略语表

第一章 绪论

1．1．2 G-四链体-配体结合模式

1．1．3 靶向G-四链体的配体小分子研究现状及进展

1．1．4 分子对接

1．1．5 发现新型G-四链体配体需要解决的问题

1．2 本论文的工作设想

第二章 构建用于对接软件评价的G-四链体-配体复合物测试集

2．1 前言

2．1．2 构建G-四链体-配体复合物测试集的策略

2．2 G-四链体-配体复合物测试集分类

2．3 结果与讨论

2．4 小结

第三章 常用分子对接软件对G-四链体-配体复合物重构的纫综合表现

3．1 前言

3．1．2 分子对接软件对G-四链体-配体复合物测试集重构的综合表现评估策略

3．2 材料与方法

3．2．1 分子对接软件及参数设置

3．2．2 复合物结构处理

3．2．3 评估参数

3．3 实验结果

3．3．1 分子对接软件对整个测试集的综合表现

3．3．2 分子对接软件对各个测试子集的表现

3．4 讨论

3．5 小结

第四部分 靶向端粒G-四链体选择性配体的虚拟筛选

4．1 前言

4．1．1 发现靶向端粒G-四链体的新型选择性配体分子的意义

4．1．2 虚拟筛选策略

4．2 实验方法与结果

4．2．1 G-四链体结构预处理

4．2．2 数据库中化合物处理

4．3．3 虚拟筛选

4．2．3 荧光共振能量转移实验(FRET) (与丁婕琴同学合作)

4．2．4 化合物抗肿瘤细胞活性测定(与高超同学合作)

4．3 小结

第五部分 总结与展望

参考文献

附录

致谢