声明
缩略语表
第一章 苏云金芽胞杆菌SigL的功能研究
1.1 前言
1.1.2σ54家族的作用机制
1.1.3 依赖于σ54的细菌增强因子结合蛋白和噬菌体休克蛋白
1.1.4 受σ54调控的基因的生理功能
1.1.5立题依据
1.1.6 目的与意义
1.2 材料与方法
1.2.1 菌株与质粒
1.2.2 主要试剂
1.2.3 培养基与溶液
1.2.4 实验仪器
1.2.5 YBT-1520中SigL和bEBP的结构和功能的生物信息分析
1.2.6 细菌双杂交实验
1.3 结果与分析
1.3.1 苏云金芽胞杆菌σ因子差异比较
1.3.2 YBT-1520中SigL的鉴定和SigL转录基因的生物信息分析
1.3.3 SigL转录基因的COG功能分类
1.3.4 8株芽胞杆菌菌株中bEBP数量和结构分析比较
1.3.5 YBT-1520中6个bEBP的结构域
1.3.6 YBT-1520中6个bEBP的σ54互作结构域详细分析
1.3.7 YBT-1520中6个bEBP功能分析
1.3.8 YBT-1520中SigB和RsbW相互作用的研究
1.3.9 YBT-1520中bEBP与PspA的蛋白质相互作用的实验验证
1.4 讨论
1.4.1 细菌双杂交系统在σ因子和抗σ因子相互作用研究中的应用
1.4.2 YBT-1520中SigL和bEBP结构和功能研究
1.5 小结
第二章 苏云金芽胞杆菌sRNA功能研究
2.1 前言
2.1.1 原核sRNA研究进展
2.1.2 反义RNA研究进展
2.1.3 蛋白结合的sRNA
2.1.4 核酸开关的研究进展
2.1.5 CRISPR的研究进展
2.1.6 立题依据
2.1.7 目的与意义
2.2 材料与方法
2.2.1 本文采用的数据
2.2.2 sRNA预测方法
2.2.3 sRNA靶基因的预测
2.2.4 功能已知核酸开关的预测
2.2.5功能未知核酸开关的预测
2.2.6 CRISPR的预测方法
2.3 结果与分析
2.3.1 基因组sRNA的预测结果
2.3.2 已知核酸开关的预测和比较功能分析
2.3.3 未知核酸开关的预测和比较功能分析
2.3.4 基因组小的新ORF预测结果
2.3.5 YBT-1520和CT-43质粒CRISPR的比较分析
2.4 讨论
2.4.1 YBT-1520中microRNA的分析方法
2.4.2 miRNA表达谱构建
2.4.3 样品间已知miRNA成熟体差异分析
2.4.4 已知miRNA成熟体比对到基因组预测前体
2.4.5 miRNA的结构分析
2.5小结
结论与展望
参考文献
致谢
硕士在读期间发表的论文
