几种生物光合色素分子体系电子激发光谱的理论研究

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本论文的主要创新点

第一章文献综述

1.1光合色素

1.1.1光合色素的结构和分类

1.1.2光合色素的吸收光谱

1.2高等植物光合系统Ⅱ(PSⅡ)的结构及功能

1.3藻类捕光系统

1.3.1藻类捕光系统的结构和功能

1.3.2藻胆蛋白光谱性质及能量传递的研究进展

1.4紫细菌光合反应中心

1.4.1紫细菌光合反应中心结构及功能

1.4.2紫细菌光合反应中心原初电子反应

1.4.3紫细菌光合反应中心电子传递机理研究进展

1.4.4紫细菌光合反应中心理论与实验光谱的研究进展

1.5理论计算方法概述

1.5.1密度泛函理论(DFT)

1.5.2含时密度泛函理论(TD-DFT)

1.5.3对称匹配耦合簇-组态相互作用方法(SAC/SAC-CI)

1.5.4 Franck-Condon理论原理

1.5.5圆二色谱(Circular Dichroism Spectrum)理论计算方法

1.5.6 PCM溶剂化模型

参考文献

第二章卟啉及其衍生物电子激发光谱的理论研究

2.1前言

2.2计算方法

2.3结果与讨论

2.3.1卟吩自由基(FBP)紫外吸收光谱的理论归属研究

2.3.2 TOPDC紫外吸收光谱的理论归属研究

2.3.3 Porphycene紫外吸收光谱的理论归属研究

2.4本章小结

参考文献

第三章藻蓝蛋白电子激发光谱的理论研究

3.1前言

3.2计算方法

3.3结果与计论

3.3.1质子化作用对藻蓝素电子结构与电子激发态的影响

3.3.2 ASP残基对藻蓝素电子激发态的影响

3.3.3藻蓝素(α-84,β-84和β-155)电子结构的比较研究

3.3.4藻蓝胆白紫外吸收光谱和CD光谱的理论归属研究

3.3.5蛋白质环境对藻蓝素电子结构及其电子激发态的影响

3.3.6藻蓝素中吡咯环之间二面角对其最大吸收峰的影响

3.4本章小结

参考文献

第四章紫细菌光合反应中心电子激发光谱的理论研究

4.1前言

4.2计算方法

4.3计算模型的选取

4.4结果与讨论

4.4.1 Rps.viridis光合反应中心紫外吸收光谱和CD光谱的理论归属

4.4.2Rb.sphaeroides光合反应中心紫外吸收光谱和CD光谱的理论归属

4.4.3不同分子簇模型对紫细菌光合反应中心电子激发态的影响

4.4.4 TDDFT和ZINDO理论计算电子激发态的比较研究

4.5本章小结

参考文献

第五章分子振动对电子激发光谱的影响

5.1前言

5.2 Franck-Condon因子的理论计算

5.2.1多维简谐Franck-Condon因子理论方法

5.2.2从头算Franck-Condon因子理论方法

5.3计算方法

5.4结果与讨论

5.4.1.振动模式的选取

5.4.2.H2CO光电子能谱的理论解析

5.4.3.基组效应对H2CO激发态精细光谱的影响

5.5本章小结

参考文献

全文总结

攻读学位期间发表的文章

致谢