• 主题
高级搜索  >
历史搜索 清空历史
首页> 中文学位 >四种葱蒜类蔬菜叶绿体DNA提取优化及比较基因组学研究
【6h】

四种葱蒜类蔬菜叶绿体DNA提取优化及比较基因组学研究

代理获取
页面导航
  • 目录
  • 摘要
  • 著录项
  • 相似文献
  • 相关主题

目录

第一个书签之前

OLE_LINK24

OLE_LINK8

OLE_LINK30

OLE_LINK2

OLE_LINK4

OLE_LINK5

OLE_LINK15

OLE_LINK37

OLE_LINK1

OLE_LINK38

OLE_LINK9

OLE_LINK10

OLE_LINK7

OLE_LINK12

OLE_LINK13

figure1

OLE_LINK20

OLE_LINK11

OLE_LINK26

OLE_LINK42

OLE_LINK28

OLE_LINK34

OLE_LINK40

OLE_LINK48

展开▼

摘要

本试验以葱蒜类大葱(Allium fistulosum L.)、大蒜(Allium sativum L.)、洋葱(Allium cepa L.)、韭菜(Allium tuberosum Rottl.ex spr.) 四种蔬菜为试验材料;对叶绿体DNA (chloroplast DNA; cpDNA)提取方法进行优化;并对其叶绿体DNA进行高通量测序和比较基因组学研究;结果如下： （1）以大葱叶片为试验材料;采用高盐低pH值法和蔗糖DNase法;对其进行叶绿体DNA提取。结果表明;高盐低pH法优于蔗糖DNase法;其DNA纯度相似;OD260/OD280值分别1.984和1.977;产率差异大;分别为0.482 μg/g和0.059μg/g;高盐低pH值法是蔗糖DNase法产率的8.17倍。设计叶绿体MatK、线粒体Atp6和核LFY基因引物;比较三种细胞器DNA的拷贝数的比值;结果表明高盐低pH法提取叶绿体DNA含量是试剂盒法的130.56倍;蔗糖DNase法是试剂盒法的5.57倍;高盐低pH法是蔗糖DNase法的23.43倍。上述结果表明;高盐低pH法提取的叶绿体DNA产率和含量均优于蔗糖DNase法。随后用高盐低pH法对洋葱、大蒜和韭菜进行叶绿体DNA提取;仍获得了较高的产率和纯度。 （2）以大葱为试验材料;进行四种葱蒜类蔬菜作物的 cpDNA 纯度优化试验。通过利用不同浓度盐离子试剂（1.0 mol/L、1.5 mol/L、2.0 mol/L、2.5 mol/L、3.0 mol/L）提取cpDNA并对纯度进行分析;结果表明1.5 mol/L为最适盐离子浓度;Percoll密度梯度及离心力筛选试验表明：3200g 为最适离心力; Percoll密度为50%时;完整的叶绿体会漂浮在Percoll层与水层中间;质量较大的细胞核碎片会沉于Percoll层底部;Percoll密度为30%时;完整的叶绿体可沉入Percoll层底部;质量较轻的细胞核碎片及部分线粒体会漂浮在水层中。两种浓度相结合;可以较好的将叶绿体、线粒体和细胞核碎片分开;纯度最好。利用本试验的优化方案得到了纯度较高的大葱、洋葱、大蒜、韭菜cpDNA。 （3）本研究对四种葱蒜类蔬菜作物叶绿体 DNA 进行高通量测序;获得了大葱、大蒜、洋葱、韭菜叶绿体基因组序列;大小分别为153109bp、153189bp、153586bp、154057bp;GC含量的百分比分别为36.9%、36.7%、36.9%、36.9%;具有4个明显的叶绿体结构特征;其长度分别为大葱LSC 82206bp;SSC 17906bp; IRA 26498bp;IRB 26498bp;大蒜LSC 82024bp;SSC 17906bp;IRA26498bp; IRB26498bp;洋葱LSC 82731bp;SSC 17932bp;IRA26461bp;IRB26461bp;韭菜LSC 83081bp;SSC 17959bp;IRA26508bp;IRB26508bp。通过基因注释及系统进化分析;葱蒜类蔬菜叶绿体基因组中含有 112 个功能基因;但是 infA 基因在韭菜中丢失;韭菜从他们共同的祖先中起源最早;随后大蒜成为一个独立的分支;大葱与洋葱在起源时间相近;具有较近的亲缘关系;他们的自举置信水平均为100%。 本研究对四种主要葱蒜类蔬菜作物叶绿体DNA的提取方法进行优化;并获得其叶绿体基因组序列;填补了大葱、韭菜叶绿体基因组序列的空白;为日后的深入研究奠定了良好的基础。

著录项

相似文献

  • 中文文献
  • 外文文献
  • 专利
代理获取

客服邮箱：kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备：11010802029741号 ICP备案号：京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有

  • 客服微信

  • 服务号