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1.1 转录组学背景介绍
1.1.1 转录组及转录组学介绍
1.1.2 转录组学的研究内容
1.1.3 转录组学的优势
1.2 测序技术介绍
1.2.1 测序技术的发展
1.2.2 RNA-Seq技术
1.3研究现状
1.3.1 RNA-seq数据分析流程研究现状
1.3.2 数据分析工具研究现状
1.3.3 外显子跳跃事件研究现状
1.4 研究内容与论文结构安排
1.4.1 研究内容与意义
1.4.2 论文结构安排
2.1 数据来源及格式介绍
2.2 质量控制
2.2.1 质量评估
2.2.2 数据过滤
2.3 序列比对
2.3.1 参考序列的选择
2.3.2 比对工具的选择
2.3.3 有参比对
2.4 结果统计
2.3.1质控结果统计
2.3.2比对结果统计
2.5 本章小结
3.1 表达定量
3.1.1 表达定量方式选择
3.1.2 表达量标准化方法选择
3.1.3 使用RSEM进行表达定量
3.1.4表达矩阵的构建
3.2 差异表达基因的筛选
3.3 基因功能富集分析
3.3.1 GO富集分析
3.3.2 KEGG富集分析
3.4 结果统计
3.4.1 差异表达分析结果统计
3.4.2 GO富集分析结果统计
3.4.3 KEGG富集分析结果统计
3.5 本章小结
4.1 外显子跳跃事件介绍
4.2 基于PSI方法的外显子跳跃事件识别
4.3 神经网络
4.3.1 神经元模型
4.3.2 激活函数
4.3.3 多层前馈神经网络
4.3.4 误差反向传播算法
4.3.5 优化方法
4.4 Adaboost.R2回归算法
4.5 基于集成学习的外显子跳跃事件识别方法
4.6 结果分析
4.7 本章小结
