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快速准确预测O-H…O型氢键复合物的氢键键长和作用能

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摘要

第一章 序言

第二章 理论模型和参数的确定

第三章 应用

3.1 计算含水分子的O-H?O型氢键复合物的氢键键长和作用能

3.2 计算含甲醇分子的O-H?O型氢键复合物的氢键键长和作用能

3.3 计算含五元环单糖(脱氧核糖和核糖)的O-H?O型氢键复合物的氢键键长和作用能

3.4 计算含六元环单糖(葡萄糖和果糖)的O-H?O型氢键复合物的氢键键长和作用能

3.5 计算含双糖(蔗糖和麦芽糖)的O-H?O型氢键复合物的氢键键长和作用能

3.6 效率

3.7 小结和展望

结论

参考文献

博士期间发表的论文

致谢

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摘要

O-H…O型氢键广泛存在于化学和生物体系中。快速准确计算O-H…O型氢键复合物的氢键键长和作用能十分重要。我们课题组提出了一种可快速准确预测N-H…O=C和C-H…O=C型氢键复合物作用能的可极化偶极-偶极作用模型。本论文对此模型进行了进一步发展,将其推广到一系列包含水、醇和糖类分子的O-H…O型氢键复合物中,对O-H…O型氢键复合物的氢键键长和作用能进行了预测。本论文具体研究内容如下:
  1.对可极化偶极-偶极作用模型进行了发展,将其推广到包含水、醇和糖类分子的O-H…O型氢键复合物中。选取6个O-H…O型氢键二聚体作为模型分子,确定了所需的参数。
  2.使用可极化偶极-偶极作用模型和所确定参数计算了大量含水、甲醇、单糖以及双糖分子的O-H…O型氢键复合物的氢键键长和作用能,并与MP2、B3LYP和AMBER99方法计算得到的结果进行了比较。发现,使用可极化偶极-偶极作用模型计算得到的氢键键长与MP2/6-31+G(d,p)、B3LYP/6-31+G(d,p)方法得到的氢键键长符合的很好;使用可极化偶极-偶极作用模型计算得到的作用能与包含基组重叠误差校正的MP2/aug-cc-pVTZ、MP2/6-311+G(d,p)方法计算得到的作用能符合的很好,远优于AMBER99方法。说明可极化偶极-偶极作用模型可靠,参数合理,可以准确地预测O-H…O型氢键复合物的氢键键长和作用能。
  3.通过比较计算氢键复合物的平衡氢键键长和作用能所需时间可知,可极化偶极-偶极作用模型所需时间仅为MP2/aug-cc-pVTZ方法所需时间的几千分之一,并且氢键复合物体系越大,可极化偶极-偶极作用模型的计算效率越高。

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