核小体定位的序列特征参数构建及人类基因转录起始区域核小体分布的统计分析

声明

摘要

第一章 引言

1．1 研究背景

1．1．1 核小体

1．1．2 核小体的定位

1．1．3 转录起始区域的核小体

1．2 论文的研究内容与安排

第二章 数据与方法

2．1 序列集合

2．1．1 基因间序列

2．1．2 转录起始序列

2．2 研究方法

2．2．1 8-mer的相对模体频数

2．2．2 m核苷的相对频数

2．2．3 核小体特征量

2．2．4 核小体占据率

2．2．5 二阶信息冗余

2．2．6 GC含量

2．2．7 相关分析

第三章 核小体特征量构建

3．1 理论依据

3．2 三核苷的相对频数

3．3 核小体特征量构建

第四章 单基因水平的核小体定位预测

4．1 TSS区域核小体特征量及核小体占据率分布

4．2 核小体特征量预测核小体定位的可靠性分析

4．3 特殊区域不同类别的核小体占据

第五章 核小体位置的统计分布及TSS区域的序列特征

5．1 TSS区域核小体位置的统计分布

5．2 TSS区域的序列特征

5．3 TSS序列的GC含量分布

第六章 总结与展望

6．1 本文工作总结

6．2 工作展望

参考文献

致谢

作者攻读硕士学位期间发表和完成的论文目录