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乌梁素海底泥厌氧不产氧光合细菌的富集培养后细菌多样性&一株盐碱湖细菌的分离、培养及分类鉴定

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1 乌梁素海底泥厌氧不产氧光合细菌的富集培养后细菌多样性分析

1.1 前言

1.1.1 厌氧不产氧光合细菌

1.1.2 乌梁素海现状

1.1.3 微生物富集培养

1.1.4 生物多样性

1.1.5 本研究内容、目的和意义

1.2 材料与方法

1.2.1 样品采集和富集培养

1.2.2 试验材料

1.2.3 总DNA的提取

1.2.4 PCR反应体系和条件

1.2.5 16S rDNA、pufLM、bchY的PCR产物回收

1.2.6 产物的连接反应

1.2.7 感受态细胞的制备

1.2.8 连接产物的转化

1.2.9 阳性克隆子鉴定

1.2.10 PCR-RFLP分析

1.2.11 测序与系统发育分析

1.2.12 多样性分析

1.3 结果与分析

1.3.1 富集培养

1.3.2 总DNA的提取

1.3.3 16S rDNA、pufLM、bchY PCR 扩增

1.3.4 克隆文库的建立与分析

1.3.5 多样性指数分析

1.3.6 系统发育多样性分析

1.4 讨论

1.4.1 富集培养总细菌和AnAnPB多样性指数

1.4.2 富集培养总细菌和AnAnPB群落组成

1.5 结论

2一株盐碱湖细菌的分离培养及分类鉴定研究

2.1 前言

2.1.1 盐碱湖环境

2.1.2 盐碱湖中的细菌类群

2.1.3 微生物系统学

2.2 材料与方法

2.2.1 样品的采集

2.2.2 菌株的培养

2.2.3 表型分类特征

2.2.4 化学分类特征

2.2.5 基因型特征

2.3 结果与分析

2.3.1 样品采集

2.3.2 MIM18T菌株的分离

2.3.3 MIM18T表型特征

2.3.4 MIM18T化学分类特征

2.3.5 MIM18T基因型特征

2.4 结论与讨论

致谢

参考文献

作 者 简 介

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摘要

厌氧不产氧光合细菌(Anaerobic anoxygenic phototrophic bacteria,AnAnPB)在水生生态系统物质和能量循环中具有重要作用和意义。本文通过对乌梁素海富底泥AnAnPB进行了富集培养,并构建和分析了基于16s rDNA、pufLM、bchY的基因文库,以期揭示富集培养后乌梁素海菌群结构变化和AnAnPB富集情况。研究结果表明,在16S rDNA基因文库中,利用Hae III对16s rDNA基因97个克隆子进行单酶切产生了20种条带,文库覆盖率达77%;在pufLM文库中,pufLM覆盖率为79%,有19种类型;在bchY文库中,bchY覆盖率为85%,有12种类型。富集后细菌丰富度高,三个文库主要类群有蛋白菌门(Proteobacteria)(16S rDNA、pufLM和bchY文库中分别占81.4%、69.5%和90%),蓝藻门(Cyanophyta)(16S rDNA和pufLM文库中分别占1.0%和26.1%),硬壁菌门(Firmacutes)(16S rDNA和pufLM文库中分别占2%和2.1%),拟杆菌门(Bacteroidetes)(16S rDNA文库中占2%),酸杆菌门(Acidobacteria)(16S rDNA文库中占2%),绿菌门(Chlorobium)(bchY文库中占2.5%),pufLM文库中存在古菌甲烷八叠球菌科(Methanomicrobia)(2.2%)。
  T从内蒙古浑善达克盐湖分离到一株MIM18 Cyclobacterium属中的Nitritalea的相似性分别为92.3%和88%,鉴定为新属,新种命名为Mongoliitalea lutea gen. nov.,sp. nov.。此菌株为好氧、耐盐、杆状、桔红色、无运动性、革兰氏阴性菌。MIM18 G+C含量为39.8%,最适NaCl浓度为1%,最适生长温度为28-37℃。主要的脂肪酸为iso-C15:0(28.1%),iso-C17:03-OH(14.6%),C15:1ω6c(5.3%,C14:02-OH和iso-C15:02-OH(5.4%),iso-C17:1ω9c或者C16:010-methyl(5%),呼吸醌主要有MK-7,极性脂主要有PC、PG和PE。,基于16S rDNA鉴定,与Belliella和T
  本研究为认识内蒙古地区水生生态系统微生物多样性,以及特殊类群微生物生态功能积累了数据,并为相关微生物应用于生态系统的保护奠定了一定的基础。

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