首页> 中文学位 >禽呼肠孤病毒S3、S4基因的克隆与序列分析
【6h】

禽呼肠孤病毒S3、S4基因的克隆与序列分析

代理获取

目录

文摘

英文文摘

声明

1引言

1.1禽呼肠孤病毒感染概述

1.2病原学

1.2.1分类、形态与特性

1.2.2化学组成

1.2.3抗原性

1.2.4培养特性

1.2.5致病性

1.2.6抵抗力

1.2.8病毒基因组及编码蛋白质的功能

1.3流行病学

1.3.1易感动物

1.3.2传染源

1.3.3传播途径

1.4临床症状

1.5病理变化

1.6诊断

1.6.1临床诊断

1.6.2病理剖检

1.6.3实验室诊断

1.7防治

1.7.1疫苗的研究

1.7.2免疫

1.8本论文研究依据及意义

2材料与方法

2.1材料

2.1.1试验用病毒株

2.1.2参考毒株序列

2.1.3菌株及质粒

2.1.4主要试剂以及试剂盒

2.1.5试验所用溶液及其配制

2.1.6主要仪器设备

2.2方法

2.2.1引物的设计与合成

2.2.2病毒RNA的提取

2.2.3病毒目的基因的一步法RT-PCR扩增

2.2.4病毒目的基因的克隆

2.2.5质粒DNA测序

2.2.6基因序列拼接

2.2.7序列比较分析

3结果

3.1病毒目的基因的一步法RT-PCR扩增结果

3.1.1 S3基因的一步法RT-PCR扩增结果

3.1.2 S4基因的一步法RT-PCR扩增结果

3.2重组质粒的PCR鉴定结果

3.2.1 S3基因的重组质粒的PCR鉴定结果

3.2.2 S4基因的重组质粒的PCR鉴定结果

3.3序列的测定结果

3.3.1 S3基因序列测定结果

3.3.2 S4基因序列测定结果

3.4序列分析结果

3.4.1 S3基因序列分析结果

3.4.2 S4基因序列分析结果

4讨论

5结论

致谢

参考文献

附录

作者简介

展开▼

摘要

本试验提取禽呼肠孤病毒内蒙古、天津地区分离株(B-98、C-98、G-98、T-98株)病毒总RNA。参考GenBank中禽呼肠孤病毒S3、S4基因序列设计2对引物。应用RT-PCR技术特异性地扩增病毒的S3、S4基因。将纯化的目的DNA与PMDl9-T载体连接,转化到DH5a感受态细胞中,应用蓝白斑法筛选阳性重组质粒,然后用PCR法鉴定重组质粒,将鉴定的阳性重组菌送生物工程公司测定S3、S4基因序列,应用计算机软件将测定序列与参考序列进行比较。结果表明测定的S3基因节段长1202bp,均包含完整的开放性阅读框(Open Reading Frame,ORF),位于31~1134 bp;S4基因节段长1109bp,包含完整的开放性阅读框(ORF),位于2~1105 bp。禽呼肠孤病毒B-98、C-98、G-98和T-98的S3基因序列已成功登录GenBank,登录号分别为EF030498、EF030496、EF030497、EF030499。四个分离株的S3基因与禽呼肠孤病毒S1133、176和鸡源番鸭呼肠孤病毒YJL的同源性很高在99.2%~100%之间:与禽呼肠孤病毒138的同源性较高在87.0%~87.3%之间;与番鸭呼肠孤病毒S14和89026的同源性较低在60.0%~64.1%之间;与哺乳动物呼肠孤病毒3和纳尔逊海湾病毒的同源性很低分别为3.8%和19.2%。四个分离株的S4基因与禽呼肠孤病毒S1133、176和鸡源番鸭呼肠孤病毒YJL的同源性很高在98.8%~99.6%之间;与禽呼肠孤病毒138和番鸭呼肠孤病毒S14和89026的同源性较高在76.4%~81.2%之间:与哺乳动物呼肠孤病毒3和纳尔逊海湾病毒的同源性很低分别为6.5%~6.6%和53.9%~56.2%。S3和S4基因系统发生树分析表明,均与禽呼肠孤病毒S1133,176和鸡源番鸭呼肠孤病毒YJL的遗传进化关系最近,分属同一进化分支。天津、内蒙古分离株的0 B蛋白和0 NS蛋白结构分析表明,它们均为亲水蛋白,等电点在6.27~7.10之间。天津、内蒙古分离株σ B蛋白和σ NS蛋白抗原位点与禽呼肠孤病毒S1133、176和鸡源番鸭呼肠孤病毒YJL相同。综上所述,禽呼肠孤病毒内蒙古、天津地区分离株S3和S4基因的抗原位点分析结果与同源性、系统发生树结果相互一致,与禽呼肠孤病毒S1133、176和鸡源番鸭呼肠孤病毒YJL的同源性最高,分属同一进化分支,且抗原位点相同。

著录项

  • 作者

    李建云;

  • 作者单位

    内蒙古农业大学;

  • 授予单位 内蒙古农业大学;
  • 学科 预防兽医学
  • 授予学位 硕士
  • 导师姓名 关平原,申之义;
  • 年度 2007
  • 页码
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 中文
  • 中图分类 鸡;病毒病;
  • 关键词

    禽疾病; 呼肠孤病毒; 基因分析;

相似文献

  • 中文文献
  • 外文文献
  • 专利
代理获取

客服邮箱:kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备:11010802029741号 ICP备案号:京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有
  • 客服微信

  • 服务号