玉米干种子胚与萌发胚MicroRNA的差异表达分析

声明

符号说明

摘要

1 引言

1．1 植物miRNA的特点

1．2 植物miRNA的生物合成

1．3 植物miRNA的作用机制

1．4 植物miRNA的生物学功能

1．4．1 miRNA与植物的生长发育相关

1．4．2 miRNA参与植物的逆境胁迫

1．5 miRNA的鉴定方法

1．5．1 传统克隆测序

1．5．2 计算机预测方法

1．5．3 高通量测序的方法鉴定miRNA

1．6 展望

1．7 本研究的立题依据与目的意义

2 试验材料与方法

2．1 试验材料

2．1．1 植物材料

2．1．2 菌株与质粒

2．1．3 培养基

2．1．4 酶与各种生化试剂

2．1．5 主要仪器

2．1．6 生物信息分析所用的数据库

2．1．7 生物信息分析所用的生物软件

2．2 试验方法

2．2．1 试验材料制备

2．2．2 总RNA的提取

2．2．3 miRNA文库构建

2．2．4 Conserved miRNA鉴定

2．2．5 Novel miRNA鉴定

2．2．6 miRNA的Real-time PCR鉴定

2．2．7 靶基因的Real-time PCR检测

2．2．8 RACE验证

3 结果与分析

3．1 Solexa测序结果初步统分析

3．2 玉米胚中保守的miRNA及丰度分析

3．3 新的miRNA的鉴定

3．4 新的miRNA的靶基因预测及GO分析

3．5 Real time PCR验证差异表达的miRNA家族

3．6 Real time PCR验证miRNA的靶基因的表达情况

3．7 miRNA的靶基因切割位点的5’RACE验证

4 讨论

5 结论

6 进一步研究设想

参考文献

附录

致谢

攻读硕士学位期间发表的论文