摘要
第一章 绪论
1.1 引言
1.2 蛋白质的功能位点
1.3 蛋白质功能位点预测方法
1.4 本方案简介
第二章 方法与过程
2.1 建立SCOP的“子结构域”(sub-domain)序列群
2.2 建立子结构域的搜索字典
2.3 计算序列功能位点,建立模版序列功能位点
2.4 用SCOP子结构域搜索字典与功能数据库预测蛋白质功能位点
2.5 筛选功能位点,给出最终预测结果
2.6 衡量预测结果
第三章 结果
3.1 大肠杆菌天冬酰胺聚合酶(Escherichia coli Asparagine Synthetase)功能位点预测(PDBid:12as,E.C.number:6.3.1.1)
3.2 甲酰四氢叶酸脱甲酰酶(Formyltetrahydrofolate Deformylase)功能位点预测(PDBID:30BI)
3.3 CASP9标靶蛋白配体结合位点预测
3.4 酶催化位点预测
3.5 Ca2+离子结合位点预测
3.6 其他蛋白质的预测结果
第四章 总结
参考文献
致谢
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