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论文说明：指导小组成员
第一章绪论
1.1研究背景
1.1.1生物学数据源和数据总量的持续增长
1.1.2生物信息学的产生与发展
1.2生物学数据集成
1.2.1生物学数据的特征
1.2.2生物学数据集成的必要性
1.2.3生物学数据集成方法
1.2.4生物学数据集成存在的问题
1.3国内外研究现状
1.4研究内容及成果
1.5论文结构
第二章半结构化生物数据的信息抽取
2.1半结构化生物数据的格式及其特点
2.1.1半结构化数据的特点
2.1.2生物数据的信息格式及特点
2.2半结构化数据抽取的相关研究
2.3半结构化数据抽取模型的构建
2.3.1半结构化数据模式
2.3.2 OEM数据模型
2.3.3 RE-OEM数据抽取模型
2.4半结构化生物数据的信息抽取
2.5实验结果及其分析
2.6本章小结
第三章GO语义相似性度量方法
3.1本体概述
3.2生物本体
3.2.1生物数据库中语义的异构
3.2.2本体在生物数据库中作用
3.2.3生物本体的研究现状
3.4相似性度量的相关研究
3.5一种基于语义路径覆盖的GO术语间相似性的度量方法
3.5.1基本定义
3.5.2算法描述
3.5.3实验评估
3.6本章小结
第四章基于GO的异构生物数据库的语义查询
4.1序列比对方法的缺陷
4.2.1 DB2GO表
4.2.2 Semantic similarity表
4.3.1浏览GO的方法
4.3.2查询GO的方法
4.3.3语义相似性查询
4.4结果分析
4.5本章小结
5.3.1 LinkDB查询
5.3.2序列完全匹配查询
5.5本章小结
第六章结论与展望
6.1结论
6.2展望
参考文献
攻读学位期间作者的工作成果
致谢
论文独创性声明和使用授权声明
