嗜水气单胞菌AH10(CCTCC AB2014155)基因组的比较分析及其耐药性的研究

声明

引言

1嗜水气单胞菌

1.1嗜水气单胞菌致病性

1.2嗜水气单胞菌耐药性

1.3嗜水气单胞菌耐药机制

1.4基因组测序

1.5测序在微生物中的应用

1.6测序与耐药

1.7本研究的目的和意义

第一章 嗜水气单胞菌AH10(CCTCC AB2014155)的全基因组测序及比较分析

1材料与方法

1.1菌株来源

1.2试剂

1.3仪器与设备

1.4所用软件

1.5嗜水气单胞菌AH10的全基因组测序

1.6ORF预测

1.7基因功能注释分析

1.8比较基因组学分析

2结果与分析

2.1 AH10 菌株鉴定

2.2 AH10基因组拼装

2.3基因的预测

2.4基因功能分类

2.5代谢通路构建

2.6基因组岛

2.7比较基因组学

2.8嗜水气单胞菌致病性分析

3 讨论

第二章 高度耐药嗜水气单胞菌的定向诱导及其交叉耐药性分析

1材料与方法

1.1菌株来源

1.2试剂

1.3仪器与设备

1.4菌株MIC、MPC测定

1.5耐药菌株获得及耐药获得速率评价

1.6耐药菌株对常见抗生素的交叉耐药

1.7耐药保存条件

2结果与分析

2.1原代菌株AH10体外测试结果

2.2供试菌株随传代次数对五种筛选抗生素的平均耐药性及得速率

2.3 耐药菌株交叉耐药

2.4耐药菌株交叉耐药比率

2.5耐药菌株对各种抗生素的耐药比率

2.6耐药菌株4℃条件下保存耐药稳定性

3 讨论

第三章 强力霉素诱导的高度耐药嗜水气单胞菌的基因组比对分析

1材料与方法

1.1菌株来源

1.2试剂

1.3仪器与设备

1.4耐药菌株获得与MIC测定

1.5全基因组测序

1.6突变位点和缺失

1.7 比较基因组分析

2结果与分析

2.1 测序数据统计

2.2 耐药性测定及分析

2.3核心和非核心基因统计

2.4 SNP 和INDEL

2.5 拷贝数变异

2.6结构变异

2.7耐药基因比对分析

3 讨论

结论

参考文献

附录：论文发表情况

致谢